Kehidupan damai Ezio telah rusak. Keluarganya dituduh melakukan pemberontakan dan dijebloskan ke penjara. Rumahnya pun dirusak oleh prajurit.

Ia lalu menyelinap ke penjara dan menemui ayahnya untuk mengetahui alasan dibalik semua ini. Ayahnya lalu menyuruhnya untuk kembali kerumah dan membuka ruang rahasia dan mengambil semua isi peti rahasia. Di dalamnya ada jubah Assassin dan juga ada surat dokumen berisi bukti bahwa tuduhan itu ialah bohong. Ezio diminta menyerahkan surat dokumen itu ke temannya, Messer Uberto. Ezio kemudian mulai perjalanan membersihkan nama keluarganya